武则天仍然不允许，只是说：
“待细察案情，再做决定。”
宋璟刚走出宫廷，武则天就让宦官传达诏令：
“命宋璟出京安抚陇蜀，即刻出行。”
宋璟不肯出行，返回皇宫对武则天说：
“陛下，按本朝惯例，御史中丞中除非外地发生了军国大事，不应出使外地。
今陇蜀安定无事，臣不敢接受您的诏令。”
武则天说：
“朕命你去幽州，督察幽州都督屈突仲翔贪污案。”
宋璟说：
“外臣犯罪，应该由侍御史、监察御史前往审查，臣不敢越权代替他们职责。”
司刑少卿桓彦范、凤阁侍郎崔玄玮，接连奏请武则天：
“请求给张昌宗按律治死罪。”
武则天说：“让法司给他重新议罪吧。”
司刑卿韦昇，奏请武则天：
“按律应处张昌宗死刑。”
武则天不准许。
宋璟再入宫请求：
“请陛下批准处死张昌宗”。
武则天说：“张昌宗已向朕自首，理应减罪。”
宋璟说：
“张昌宗是看到街上到处贴着揭发他谋反的告示，实在没有办法掩盖了，才去自首，不是他本心想自首。
谋反大罪，不应宽判，如果张昌宗不受诛伏法，国法还怎么遵行？”
武则天好言劝解宋璟：“网开一面，留人生路。”
宋璟厉声说：
“张昌宗格外受到恩宠，我知道我主张杀他，会给我自己惹出祸来！
我因义愤填胸，就算我坚持主张，为此死了也不后悔！”
武则天一听，脸色都变了。
内史杨再思在边上，担心宋璟抗旨招来大祸，于是发布内史敕令说：
“宋璟！我命你立即退出朝堂！”
宋璟说：
“圣明皇上在此，臣正为面聆听陛下贤德之声。不用内史随意发布敕令驱赶我！”
武则天无话可说，只好下令：
“张昌宗案复审。令张昌宗、张易之到御史台接受审问！”
宋璟走出宫廷，即到达御史台主持审讯张昌宗。
宋璟刚刚问了张昌宗几句话，忽然有宫内宦官手持皇帝诏令，匆匆赶到御史台审讯室，宣读圣旨说：
“诏命御史台宋璟：暂停审讯张昌宗、张易之。命张昌宗、张易之应召入宫伴驾。”
宋璟不好强行追还，长叹一声说：
“我竟傻到没有事先吩咐刑吏直接击碎张昌宗这个反贼的脑袋，一转眼他又被召回宫，后悔无极了！”
即而武则天竟然吩咐张昌宗到宋璟宅府道谢不杀不审之恩。
宋璟知道武则天庇护二张，审案已无法进行。心里气恨，拒绝见张昌宗，让家中仆人给等在家门外的张昌宗传话说：
“公事公办，如果我私下见面便是违法。王法怎么允许罪犯和刑官私下勾连坏法？”
张昌宗惭愧又痛恨，几天后派刺客暗杀宋璟。
夜幕下刺客翻墙进入宋府，持刀进入宋璟寝室，找不到宋璟，原来宋璟事先得知张昌宗派人暗杀他，晚上到别的地方借宿去了。
