“第三次……世界大战……”
冈部难以置信地听着阿万音铃羽的话语。β世界线的残酷，依旧在时间线的远方等待着自己和身边自己所重视的人们。
面对已经受够了时间跳跃，不想再改变世界线的冈部，阿万音铃羽冷漠地说道：
“冈部伦太郎，如果我说要避免世界大战的发生，需要的是拯救在2010年7月28日死去的牧濑红莉栖的话呢。”
“什么意思？！”听到不再是“打工战士”的铃羽的话，冈部震惊地望着她。
“详细的情况我并不清楚，但是我接到的任务只有一个，拯救牧濑红莉栖，前往唯一不受世界线收束范围影响的世界线——steinsgate！”阿万音铃羽如此说道。
在本村哉志和冈部一样震惊的目光中，画面转向了OP。标题的《Steins；Gate》在这一刻紧紧地抓住了本村哉志的心，一切的线索都从第一季开始在脑海中理顺下来，原来，牧濑红莉栖的死，也不是结局吗？
那么冈部究竟要如何拯救死于2010年7月28日的牧濑红莉栖呢？
OP的歌词悄然变换。
“生命的论点和无意义的证明，对你而言，是就连消遣也算不上的滑稽。”
“自称支配者的愚蠢种族，陈列出狂妄自大的幼稚定理~”
……
“为此面对欺骗时间，所剩下的装置，不会再有迷茫，孤独的观测者啊~”
早就被OP俘虏的本村哉志没有跳OP的意思，和之前的OP不同，这里的OP歌手声线中潜藏的悲伤的压抑似乎都消失了，取而代之的却是希望坚持，就像是不再迷茫的孤独观测者一般。
怀着对接下来发展的疑惑，本村哉志注视着冈部和铃羽乘坐时间机器回到了2010年7月28日，那个α世界线中牧濑红莉栖被杀死的那天。
当时牧濑红莉栖对尚在中二时期的冈部伦太郎所说的话就非常地让本村哉志在意，现在看来，果然是冈部进行了时间旅行产生的不和谐之处。
乘坐时间机器而来的冈部为了不产生时间悖论，避开了原来时间线上的冈部和真由理，在绕路前去八楼的时候，他遇到了红莉栖。
无法压抑自己心情的冈部被红莉栖视作了怪人，但是广播馆里的广播唤醒了他的意识，让他离开了那里，来到了自己曾经目睹红莉栖死亡的地方。
在这里等待了一会儿，红莉栖果然也出现在了门口，然而她等待的人，却让冈部一惊。
中钹博士来到了这里，红莉栖居然对他喊出了“爸爸”，原来，牧濑红莉栖的父亲就是中钹博士吗！？
红莉栖整合了自己的理论，得到了时间机器原理的论文，她本来想要和父亲中钹博士一起署名发表，中钹却只想要窃据女儿的研究成果，父女俩之间因此起了争执，难以忍受红莉栖被中钹伤害，冈部愤怒地冲了出去。
原来中钹就是红莉栖那个因为研究时间机器而被协会除名，因此在学界名落千丈的父亲，也是因此，中钹才会将自己优秀的女儿视作眼中钉。
对他来说，女儿过分的优秀就是在自己的伤口上撒盐，笨拙地对待亲情的红莉栖，一次次地引发了他内心深处潜藏的黑暗，最终，面对破坏了自己见面会的红莉栖和冈部，他愤恨地取出了随身携带的折叠刀。
难道说，居然是中钹将红莉栖杀死了吗？本村哉志从未想到过世界上居然会有这样的人渣父亲，不但不要脸地窃据女儿的研究成果，还要残忍地将自己的亲生女儿杀害！
