郑芝龙投降满清，多铎留下他的印信，将郑芝龙送往北京。
对于郑军降军，则宣称郑芝龙自愿入京面见大清皇帝，郑军直接接受多铎的指挥。
郑军将领或许觉得有些不对头，可是已经剃发，主公郑芝龙又去了北京，便只能依令来福州，听从多铎调令。
多铎立时对郑军降军，进行整顿，得兵七万余众，战船四百余艘，清军实力瞬间大涨。
自金华、岳州、赣南等一系列的战役下来，明清间的局势，本来已经有所改观，逐渐进入相持阶段。
此时郑芝龙投降，将福建一省拱手相让，不仅使得清军不费吹灰之力获得一省版图，也使得抗清大局再次崩坏。
郑军降清，明军少了几万人，清军多了几万人，这一减一增之下，清军兵马立时比明军又多了十余万，而且还获得了清军最欠缺的水师人才。
除此之外，福建被清军攻下后，明军各个战场立时被动起来，浙江失去福建这个依托后，陷入了清军的三面包围，局势极为被动。
两粤原本属于明军的腹地，乃是大后方，只需安心生产，提供兵源和钱粮。
现在清军占据福建，直接威胁广东，而广东兵力空虚，必然需要从湖广和广西抽调兵力，这便必然会削弱湖广明军，使得明军兵力不足，彻底陷入被动。
在这种情况下，明军彻底陷入被动之中，抗清局势再次岌岌可危起来。
在郑芝龙降清，清军控制福建大部之时，逃脱至瑞金的隆武和郑成功，已经被清军围困了大半个月的时间。
瑞金位于江西省东南部，在赣州之东，与福建汀州相临。
这里地形多山，东南是武夷山西麓，西北是紫华山、火焰嶂、天子岭环抱，东北和西南也是丘陵起伏，重峦叠嶂，只有瑞金县城位于一小块盆地之内。
此时，瑞金小县城内，挤满了近三万明军，城墙和街道上，到处横七竖八的躺着禁军将士。
明军士卒遍布城内，或立，或站，或卧，许多士兵抱着枪杆，靠着街道边的墙壁而坐，目光呆滞，神色凄惨。
三万禁军，在郑成功的统帅下，一路冲破郑军的阻拦，逃到了瑞金，眼看着将要进入赣南，清军追杀而至，明军仓惶入城，便被清军围了起来。
明军进入瑞金，虽有了依托，但是瑞金周围都是山丘，小县城内物资匮乏，明军进入瑞金后，很快就陷入缺粮的境地。
这时再次打退清军攻击的明军士卒，躺在城内，缺衣少食，寒冷、饥渴、恐惧，正撕咬着守军，消磨着明军的精神和气力。
在县衙内外，空地上同样躺满了明军士卒，堂内隆武帝坐在中堂，郑成功、阎应元等人，齐聚于大堂内，正商议着军情。
隆武帝穿着破旧的龙袍，头带翼善冠，看着众人，脸上露出焦急之色，“几位卿家，现今清军围城，为之奈何？”
明军被困在瑞金，小县城的物资，无法支持三万明军长期坚守，若坐以待毙，城中粮尽，必被清军所破，隆武皇帝和众人都是满怀忧郁。
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