按照剧情，是辉夜吃了查克拉果实，又被羽衣抽取十尾查克拉分为九只尾兽，创建忍宗大肆帮普通人修改基因获得提炼查克拉的能力。
忍者死亡查克拉自然逸散到空气中，这才给了三大圣地吸收查克拉的机会，进而将仙术改良到三元的层次。
三大圣地都是自然能量充沛的灵地，这才让蛤蟆、蛇、蛞蝓诞生出智慧，他们此时的仙术，对于郑昊来说意义并不大。
所以，郑昊让羽衣帮三大圣地的代表改造了一下基因，赋予他们自行提炼查克拉的能力，并派羽衣随同三位代表前往三大圣地，帮助三大圣地进行种族的进化，让这三族都拥有提炼查克拉能力。
这里又得说一下大筒木一族的另一个能力，如辉夜这般的被守护者，还能直接凝聚游离在空气中的查克拉为查克拉果实。
所以很简单的逻辑，会提炼查克拉的生命越多越好，只要没有大筒木一族那么漫长的寿命，就会不断提升空气中的查克拉浓度。
郑昊不得不叹服大筒木一族的高明。
……
郑昊成了羽衣和羽村的爸爸，自然就没有忍宗这种东西了，等到羽衣和羽村从三大圣地回来，郑昊又给他们派发了新的任务——给祖之国所有国民分享查克拉。
再配合上修仙，提炼查克拉到细胞、灵魂都疲惫，然后修仙，真元在体内流转，滋养细胞的同时又能汲取微量的身体能量，冥想恢复精神力。
不过也不是那么简单，丹田就那么大，又要储存真元，又要储存查克拉，其中查克拉提炼速度要比真元快。
现在的查克拉使用方法很匮乏，除了辉夜和羽衣的血继网罗，羽村都只有血继淘汰。分享查克拉只有辉夜和羽衣能做到，羽村跟着羽衣，郑昊只是想让他跟着一起游历一番。
等到羽衣的长子因陀罗这个天才开发出印，再在印的基础上开发忍术，查克拉的实用性就会远超真元。
毕竟，真元一来积累更耗时，也不像查克拉那么结构稳定，修仙者消耗真元后，真元离体后会短暂保持结构，然后很快分解，分解后身体能量和精神能量脱离了自然能量粒子的载体，很快就会做功被消耗掉。
真元可以作为一种补充，可以温养身体，增强生命力，加速基因进化，以及开拓丹田。
郑昊是不准备像查克拉这样大力普及的，随缘。
一切都已走上正轨，郑昊这个祖之国皇帝为了集权和反腐，留着一个分身处理政务，白绝是最好的耳目，神出鬼没。
统一天下后，辉夜抽空去和神树合体了一次，施展了一次神树界降临，让神树根系在预定好的城市破土而出，节省下押送罪犯到神树主体的时间和资源。
郑昊收回了几个分身，增强本体真灵的计算力，专门攻关，剩下的分身则负责做一些耗时的工作。
一时间早就进度缓慢的真灵神格完善工作终于提速，在羽衣和羽村两兄弟走遍祖之国帮全体国民修改基因后即将返回都城前，郑昊终于完成了真灵神格的“雷达”和“接口”。
