几万光年外，一艘星盟超级航母正式建造完毕。
漫漫长夜号 - CSO级超级航母：全长米，宽1147米。
它配置了1个超重型挖掘光束阵列、12个超重型等离子光矛、20个重型等离子光束阵列、80个重型等离子光束发射器、32个重型等离子鱼雷发射管、800门速射脉冲激光炮。
漫漫长夜号还有两个可以对3000米级别的ORS级重型巡洋舰进行维修的超大维护平台。航母所携带的资源，足以提供500艘星盟主力战舰1年的用度。
舰载成员：4000名战斗侍从（白甲及以上精英）、名战士（普通精英、鬼面兽）、2800名猎人、奴兵（豺狼人、野猪兽），其他乘员5000名左右。
舰载载具：魅影运兵船1000艘、天使重型战斗机2000艘、妖姬单兵战斗机5000架、圣甲虫超级作战平台1000台、亡魂作战坦克5000台、
除此以外，漫漫长夜号有一只圣赫利特殊部队，由100名金甲狂徒组成的战舰防卫部门，其中一半是可以自定义头盔装饰的老兵。
星盟科技发达，由于有舰载能量防护盾的技术，所以他们更喜欢坚船利炮。星舰越大，他们就越有安全感。相比之下人类的各种战舰就小得多，人类更喜欢机动灵活的小型战舰，可以方便战术部署和‘外科手术’式的精准打击。
因为人类舰队的战力相比星盟的战舰差了太多，只能玩玩战术和操作。
人类节节败退，为了不让星盟找到地球的位置，联合国太空指挥部发布了科尔协议。这个协议条文繁复，不过只有一个宗旨，就是阻止星盟获得人类最后的家园-地球的坐标，哪怕是牺牲生命也必须遵守。有星盟战舰追击不得跃迁至地球，所有的军事或者民事设施中地球的坐标都是绝密信息，如果人员撤走，必须把计算机中的信息全部删除。
此条协议大于个人生命安全，包括所有军衔的将军。
人类几乎没有退路可走了，但是人类并没有放弃。特别是一个对于这场战争来说至关重要的女人。
今天，哈尔西博士照例来到了自己位于地下的办公室。
她是斯巴达二期计划的总负责人。斯巴达二期计划开始于2517年，该项目在最初设立了一系列目标。
第一点便是训练一批精英士兵旨在镇压叛乱，避免大量军事人员伤亡。
第二个目标是保证最小的平民伤亡和避免内战。
第三个目标是大幅度降低常规手段开销就是同叛军的和解成本。
当时人类还未接触到任何外星种族。这个计划的初衷说白了就是军情局想省钱，制造一批超级特种兵，用非战争的方式平定各处殖民地的叛乱。
在这个计划的初期哈尔西做出了十分激进的建议，寻找人类婴儿中基因优秀的孩子，并观察其成长，然后把符合条件孩子应征为培养目标。为了将计划的保密，孩子们都被快速克隆体替换，而这些克隆体都有极大的生理缺陷带有众多的生理并发症，不久便会死去。这颇有争议的创造士兵方法使得这计划必须被隐藏在高度机密的保护之下。
也就是说包括约翰在内，75名孩子全部都是被她绑架来的。
哈尔西经过视网膜、指纹、声纹，甚至脑电波都检查了一遍，经过十多个安全检查点，才能到达自己的办公室。这里与其说是研究基地，更像是个流放之地。因为斯巴达二期的计划在完成初期被军情局判定为过于浪费，并且排挤出了高级项目名单。备受冷落的哈尔西被安排到了这个“无坚不摧”的研究设施里。
风水轮流转，跟星盟的战争开始以后，斯巴达战士们在战场上大放异彩，哈尔西的地位和权威飞速提高。现在她的研究经费充足，甚至在海军情报局总部都有一间独立的办公室。
但是这个要强的女人并没有搬过去。因为只要留在这个“流放之地”，军情局的大人物们想要见她，就必须通过那条布满满安全岗哨的煎熬之路。这真是一种绝妙的讽刺。
当然，她更关心的是重回正轨的斯巴达计划。她在研发雷神之锤战甲的改进，为此她甚至研发出了聪慧型的人工智能。
这间办公室里就正好有一个。
一块发光的电子装置上忽然出现一个女孩。全息投影下看的很清楚，她一头短发、脸庞清丽、身材纤细。她的身上有着蓝色的几何图案和条纹线路，这些图案上闪烁着数据流的光芒。
这就是哈尔西博士用自己克隆体的大脑作为原型，开发出的人工智能-科塔娜。
所以，科塔娜基本上就是年轻版的哈尔西博士，相貌、身材，甚至性格。这个人工智能异常聪明，渴望知识，并且自负于自己的博学多才。
科塔娜用她的聪明才智加上现有数据的计算，她假设了一个大胆的计划。而且，这个计划也得到了海军情报局和联合国太空指挥部的首肯。并且把这个计划的取名为：
红旗行动！
根据海军情报部门的研究，星盟是一个多种族联合同盟，担任最高领袖的是一个名为圣西姆的高智慧种族。现在有三个圣西姆人担任最高领袖-先知的职位。这个行动的目标就是绑架一位先知，通过谈判胁迫星盟停止战争。
为此人类必须派出斯巴达战士，劫持一艘旗舰级别的星盟战舰，破译出星盟总部的位置，找到并抓住至少一个先知带回来。为此可能需要出动几乎所有的二期斯巴达战士。
这个任务还有两个条件需要改进。
第一个是雷神锤护甲的最终升级。新的护甲中需要带着一个超导夹层，可以把人工智能加载到护甲里。也就是说，每一个斯巴达战士都可以得到一个人工智能AI的辅助。
哈尔西问科塔娜：“你想陪哪一个斯巴达战士上战场？”
科塔娜眼前浮现出二期斯巴达战士们的资料。她用指尖勾勒着约翰脸上的轮廓：“就是他了。深邃的眼睛，这个男人像是野兽一般充满着吸引力。”
