1944年9月上旬，八马所部攻克了东帝汶，九马所部攻克了苏拉威西岛，为了不与美澳联军起冲突，温暖命令停止进军，原地组织自治机构。
1944年9月下旬，雨季即将过去，老挝、柬埔寨、越南、马来半岛、苏门答腊群岛、爪洼群岛、加里曼丹群岛、苏拉维西群岛、努沙登加拉群岛、东帝汶一共63个自治邦宣布独立，并加入暹罗发起的东南亚联邦，成为东南亚联邦共和国的一员。
各自治邦除了军事、国家安全统一由联邦军政府行使权力外，其它事务由各自治邦自行处理。
英国、法国、荷兰、葡萄牙发表措辞强硬的声明，强烈反对。
温暖不予理睬，命令马仔们除了军事、国家安全以外的职权移交给扶植起来亲近人士，改组军政府班子职权：
大马担任联邦三军总司令兼东南亚联邦共和国军政府总理，二马担任陆军总司令，三马担任空军总司令，四马担任海军总司令，五马担任国家安全部长，六马担任守备集团军司令，七马担任陆军第一集团军司令，八马担任陆军第二集团军司令，九马担任陆军第三集团军司令。
九人组成东南亚联邦共和国军事委员会，大马担任军事委员会主任委员，其余八人担任副主任委员，重大事项由九人投票决定。
改组后联邦军人数达1800万，其中陆军野战军800万，陆军地方守备军800万，空军190万，海军10万。
在驻印军开始反攻几个月之后，国内滇西的中国远征军反攻开始。1944年5月11日第20集团军强渡怒江，于6月底血战至腾冲附近。
经过3个月的战斗，于9月14日解放腾冲。第11集团军于6月1日渡江，新28师于4日攻克腊猛，进围松山，由于敌阵坚固，该师五攻未克。
7月1日改由第8军来攻，该军以三个师轮换进攻，连续九次，到9月7日方破敌阵，全歼守敌。1944年10月16日，国军新一军与新六军开始向八莫发起进攻。
1944年10月17日大马下达命令：
九马指挥100万野战军、100万守备治安军、20万空军守卫加里曼丹群岛和苏拉维西群岛。
八马指挥200万野战军、200万守备治安军、30万空军守卫苏门答腊群岛、爪洼群岛、努沙登加拉群岛、东帝汶。
七马指挥300万野战军、200万守备治安军、80万空军，为进攻缅甸主力，从大其力直插曼德勒。
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