气管黏膜水肿、充血并间有出血。
气管渗出从浆液性到干酪性不等，有时可造成阻塞，导致呼吸困难。
眶下窦肿胀，有浆液性到浆液脓性渗出物。
产蛋家禽可见卵黄性腹膜炎，卵巢、卵泡充血、出血、畸型、萎缩、发育停止。
特别是输卵管无韧性和弹性、柔软易碎、黏膜潮红充血或瘀血，管内有胶样黏稠渗出物，并有成形禽卵滞留。
有的输卵管萎缩或发育停止。肾脏肿胀，伴有尿酸盐沉积。
胰腺有白色坏死斑点。
鸭LPAI也可发生窦炎、结膜炎和其他呼吸道损害，显微变化主要为肺炎，常见异嗜细胞性到淋巴细胞性气管炎和支气管炎。
死于LPAI的鸡，淋巴细胞减少，法氏囊、胸腺、脾脏和其他区域中淋巴细胞坏死或凋亡。
LPAI破坏免疫细胞和免疫器官，引起严重免疫抑制是并发感染病情加重的重要原因。
2.高致病性禽流感(HPAI)
家禽的HPAI在内脏器官和皮肤有不同程度水肿、出血和坏死，但最急性型可能无明显病理变化，典型病例可见全身组织器官严重出血。
头面部、颈部和趾部肿胀，有出血斑点，尤其是冠髯及胫部鳞片下常可看到坏死、出血和发绀。
内脏器官最常见的是病变是浆膜和黏膜的严重出血和坏死，尤以十二指肠、小肠、心外膜、胸肌、胃黏膜出血最为突出。
盲肠扁桃体、胰腺、脾脏及肾脏也常见到出血、坏死。
肺充血或出血，有局灶性到弥漫性肺炎并伴有水肿，法氏囊和胸腺通常萎缩。
组织病理学变化基本上由多个器官坏死和/或炎症构成。
受害最严重的组织是脑、心、肺、脾、胰和初级与次级淋巴器官。
脑组织常见的变化是淋巴细胞性脑膜脑炎，伴有灶性胶质细胞增多，有神经元坏死和噬神经细胞现象，但也有水肿和出血。
心肌细胞从灶性变性到多灶性-弥漫性、凝固性坏死，常伴有淋巴组织细胞炎症。
法氏囊、胸腺和脾脏常见淋巴细胞坏死、凋亡和减少。
骨肌纤维、肾小管上皮细胞、血管内皮细胞、肾上腺皮质细胞和胰脏腺泡细胞有坏死。
【诊断】
通过临床症状、流行病学和病理变化分析可以做出初步诊断。确诊需检测Al病毒抗原或基因，或分离鉴定AI病毒。
泄殖腔和气管拭子是通常的样品来源，内脏器官样品应无菌采集，与肠道和呼吸道样品分开保存。
内脏器官含有病毒是全身感染的标志，尤其是HPAI的特征。
直接检测A1病毒抗原的方法有抗原捕捉ELISA、荧光抗体技术、免疫酶组化法等；直接检测AI病毒基因的方法有标记核酸探针原位杂交法、RT-PCR法等。
A1病毒的分离鉴定首先是测定分离的病毒是否有血凝性；其次用血凝抑制试验以排除其他血凝性病毒的可能性；然后用对型特异的NP或M蛋白的琼脂扩散试验等方法确定是否为A型流感病毒；最后确定HA和NA的亚型。
OIE判断HPATV的标准是：
含流感病毒尿囊液，做1：10稀释，静脉内接种8只4～8周龄易感鸡，每只0.2mL，如在10d内死亡6只或以上，则为HPAIV，死亡5只或以下则为LPAIV；
或用上述稀释尿囊液接种10只4～8周龄易感鸡，每只0.1 mL，观察10 d，计算静脉内致病指数(IVPI)，如大于1.2则为HPAIV，如小于1.2则为LPAIV。
对于上述动物试验中确定为LPAIV所有的H5和H7亚型病毒则必须测定血凝素裂解部位的氨基酸顺序，如果相似于其他的HPAIV，存在多个碱性氨基酸序列，则该受检病毒被视为高致病性的。
在临床上应注意将本病与新城疫、传染性法氏囊病和传染性喉气管炎相区分。
【防控】
对于必须报告的禽流感尤其是HPNAI，首先依靠严格的生物安全措施预防；如不慎被引进则应在第一时间向兽医行政管理部门报告，果断采取隔离封锁、扑杀销毁、环境消毒等措施，防止疫情扩散。
如果NAI疫情扩大到较大的范围，而且持续相当长的时间，变为地方流行性，这时已很难用隔离封锁和扑杀销毁的措施来消灭疫点，使用疫苗是可供选择的控制方法之一，但是作为整个控制策略的一部分，而不应完全依赖疫苗乃至乱用疫苗。
H9亚型和H5亚型的禽流感灭活疫苗对同亚型AIV引起的疾病均有很好的保护作用，但必须考虑禽流感病毒，特别是H5N1亚型病毒，在免疫压力下抗原漂移的速度快，疫苗对不同流行毒株的保护率存在较大差异。
对于NAI，除加强生物安全措施和使用疫苗以控制疫情和减少经济损失外，还应制定地区性和全国性控制和根除的中长期规划，以期最终消灭它，达到不免疫无病状态。
