就这样凌駉在山东得以开辟了一块敌后根据地，利用游击战术，不时骚扰一下大顺军，慢慢的巩固着山东地方的明军实力。
后来凌駉听说朱由崧在南京登基为弘光帝，马上派人上疏与南明朝廷建立了联系。
当时的弘光朝廷也觉得凌駉是个人才，给他升职加薪，升任凌駉为浙江道监察御使，并命他巡按山东。
这时清军入驻北京，凌駉意识到事态的严重性，上奏南明朝弘光帝，请求朝廷派出一支军队配合自己守住山东战略要地。
凌駉提出明为“权通北好，合兵讨贼”表面文章，实则拖延时间“名为西伐，实作东防。”
凌駉的策略就是要迷惑满清，暗中积蓄力量保卫明朝在山东的力量，可惜他的这个建议虽有可取之处，却没有得到弘光朝廷支持。
这时南明朝廷内部朝臣表示，没看到我们现在忙得很。
派兵山东？
没空。
南明朝臣在忙什么？忙于内部斗争，一直没有派一个兵来固守山东战略要地。
最后等到崇祯十七年九月，清兵南下攻略山东的时候，凌駉坚持不住，不得不放弃山东这个根据地，准备前往南京。
满清得知凌駉是个人才，找人拿着兵部给事中的官印文书去招降凌駉。
但人家凌駉对满清的赏识一点也没兴趣，他把满清的官印悬挂在陈桥驿的房间里，自己悄悄的去了南京。
凌駉逃回南京后，有幸第一次拜见了弘光帝，被朝廷派去巡按河南，驻守归德府。
接下来如果按照历史走向，凌駉在归德府就会马上碰上南下的多铎。
多铎为了显示大清广纳人才的诚意，会派人劝降凌駉。
但是凌駉一点也不给多铎面子，直接把劝降的人斩了（駉斩之以徇。）
两国交兵不斩来使，你个读书人还这么不讲道理，所以多铎很愤怒，下令全军包围归德城，不能让一个人逃跑。
多铎表示：老子一定要抓住你，让你跪在老子面前唱征服。
但是多铎太小看人家凌駉了，人家凌駉非但没想着逃跑，他还准备化被动为主动，决定次日率兵出西门劫营清军。
凌駉按照原定计划，自己亲率一支敢死队悄悄从西门出发，准备给清军来个出其不意。
然而凌駉没有料到的是，在他命人打开西门出城的同时，东门却被总兵王之刚命人打开了，把清军迎入城内。
这下好了，凌駉前脚刚出归德城，家却被人偷了。最后凌駉被俘宁死不屈，英勇就义。
凌駉自崇祯十五年进京赶考成为进士至英勇就义牺牲，三年多的时间一直奔波在各地，没有再和家人见过面，他临死前连自己出生的孩子都不曾见上一面。
“臣河南巡按凌駉参见皇帝陛下，万福圣安。”
这时有个声音打断了低头沉思的朱由崧。
朱由崧抬起头，面露微笑，“凌卿来了，快快平身。”
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