第三任妻子英格兰国王约翰一世的女儿英格兰的伊莎贝拉(1214年-1241年12月1日)，于1235年7月15日在德意志的沃尔姆斯举行婚礼
腓特烈/佐敦/查理奥托(1236年春天-1236年)
阿格妮丝(1237年)
亨利奥托(1238年2月18日-1253年5月)，以他的舅父英格兰国王亨利三世的名字为名;被委任为西西里总督及承诺在父亲死后继承耶路撒冷国王，但是在父亲死后三年亦去世。曾许配给许多教皇英诺森四世的侄女，但从未与任何人结婚。
腓特烈(1239年/1240年-年青时去世)
玛格丽特(1241年12月1日-1270年8月8日)，与图林根伯爵、其后迈森藩侯阿尔布雷希特结婚
与意大利贵妇比安卡·兰恰(约1200/10-1230/46)，大概于1225年开始关系。其中一个来源阐述他们的关系维持了20年。有记载在比安卡临死前两人曾结婚，但是不被教会承认。比安卡与腓特烈二世有三名子女，腓特烈二世将他们两人的子当成合法子女看待:女儿康斯坦丝嫁给尼西亚皇帝成为皇后及在他的遗嘱中委任曼弗雷德为塔兰托亲王及西西里国摄政。
康斯坦丝(安娜)(1230年-1307年4月),与尼西亚皇帝约翰三世结婚
曼弗雷德(1232年-1266年2月26日，死于贝内文托战役)，先是西西里国摄政，其后夺去侄儿康拉丁的王位成为西西里国王(1258年-1266年在位)
维奥兰迪(1233年-1264年)
讲完霍亨斯陶芬家族好战好色的腓特烈二世，我们言归正传继续讲哈布斯堡家族的鲁道夫一世。
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