突厥车薄这次叛乱，李治想派兵西征，挑选不出合适统帅，急切之间没法发大军征讨。
幸亏安西都督王方翼，虽然属下兵马不多，他不怕突厥叛兵人多势众，同他们在伊犁河岸发生激烈战斗，击败突厥叛兵，斩敌首一千多级。
突厥十姓酋长，不甘心失败，再次领兵来犯。王方翼又出兵塔里木盆地伊塞克湖附近 ，和突厥军队对阵作战。
战斗中王方翼左臂被流箭射中，箭矢贯穿手臂，不仅剧痛，且行动不便。
他抽出佩刀，把露在手臂外面的箭杆砍去，忍痛指挥战斗，大败突厥叛兵， 还活捉突厥军队小头目三百多人。
反叛首领车薄逃到外国去了，西突厥恢复安定。
王方翼是善于选用人才的裴行俭生前提拔的将领，果然表现不凡。
东突厥残余阿史那骨笃禄，阿史德元珍，召集收拢逃散的突厥兵士，占领了黑沙城（今内蒙武川），又侵掠并州。
他们杀死领唐军抵抗的岚州刺史王德茂，兵分多路抢掠。
唐高宗李治再起用薛仁贵为右领将军，兼检校代州都督。
薛仁贵率兵到云州，截击阿史德元珍。
阿史德元珍看见唐军阵内，出现“薛”字旗号，不由得大为惊异。
阿史德元珍出马大声喊道：
“唐军将领是谁？敢来和我一战么？”
薛仁贵在阵后应声答道：
“我乃是大唐将军薛仁贵，难道害怕你这样的无名毛贼？”
阿史德元诊说：
“你别来骗我！
薛将军被问罪流放，早已死在流放地。
怎么再会有第二个薛仁贵呢？”
话刚说完，唐军阵中冲出一员大将，胯下骑一匹健壮红鬃马，手里提一杆方天画戟。
他前额丰满、胡须修长，精神矍铄，瞪着眼睛对阿史德元珍说：
“本帅薛仁贵，奉天子命，特来剿灭你们这等毛贼。
你知道本帅厉害，应该绑了自己来归降，为什么反说我已死？
你可以仔细看看，本帅是真的还是假的？”
说着，单手摘下战盔，让他辨认脸面。
阿史德元珍吓得脸色变了，回马逃奔。
突厥兵纷纷下马跪拜，一边拜，一边后退。
薛仁贵领兵乘势进击，杀得突厥兵东逃西窜。
唐军突击突厥兵，似风卷残云一般。斩杀突厥兵上万人，俘虏三万人，缴获马、牛、羊、骆驼三万头，获得云州大捷。
薛仁贵胜利回师，后来在代州任上得了病，于683年二月去世，终年七十岁。
高宗听说薛后仁贵去世，追赠他为左骁卫大将军。令负责部门提供丧葬车马，派人护灵柩回归河南故乡。
随后，吐蕃来进犯河源。
唐侍御史娄师德，出任河源军经略副使，和吐蕃军队在白水涧岸边开战，八战八胜。
吐蕃兵丧失了士气，相继逃去。
高宗李治升娄师德为左骁骑郎将。
娄师德上奏章请求辞官，李治说：
“你文武兼备，不能辞官。”
娄师德是郑州原武人。以进士出身，转任武官。他度量弘远，智勇深沉。
从裴行俭去世后，朝中能文能武的大臣，就数娄师德。
唐朝抗击夷狄，除唐太宗李世民御驾来征外，全靠这些武臣猛将。
李治虽然平庸懦弱，但还有前朝几员猛将存留，出外征战平乱。唐太宗高宗年代，大唐声威遍及四方。
当时设置都护府，镇抚东西南北。
都护由朝廷直接派遣，都督刺史可以就地选任，少数民族酋长，担任都督、刺史的不少。
六大都护府是：
一，安东都护府。一开
