东林党人坚决抵制福王一脉继统，当时被视为东林党魁的礼部侍郎钱谦益，曾两次从原籍常熟赶往南京，以“立贤”为名，到处游说，提议迎立潞王朱常淓。
东林党人的意见，让偏向东林党的史可法摇摆不定。史可法为南京兵部尚书，位列南京众官员之首，他的影响力和地位举足轻重。
他内心里对拥立福王有所顾忌，但又认为应该按伦序迎立万历皇帝的子孙。东林党所提议的潞王朱常淓，是万历皇帝的侄子，关系又远了些。
一番斟酌后，远在广西的桂王朱常瀛，进入了史可法的视线。他是万历皇帝第七子，泰昌皇帝异母弟，天启和崇祯二弟的亲叔。
虽说由桂王朱常瀛继位，是侄死叔继，比不上朱由崧的兄终弟及。但这个人选，东林党人认可，手底下有军队的马士英也认可。
当时史可法曾暗自前往浦口，同凤阳总督马士英商量，在桂王与福王之中选定一人。史、马密商的结果是“以亲以贤，惟桂乃可”。
而南京的官绅对于这个折中方案也很满意，甚至他们已经开始准备乘舆法物，前往广西迎接桂王。
然而就在这一关键时刻，似乎和帝位无缘的福王朱由崧，完成了绝地翻盘。
担任守备凤阳太监的卢九德曾服侍过朱常洵，在朱由崧的策划下，卢九德出面联络三镇总兵高杰、黄得功、刘良佐。希望三个有兵权的总兵，能够支持福王继位。
“时王闻，惧不得立，书召南窜总兵高杰与黄得功、刘良佐协谋拥戴。刘泽清素狡，先附立潞议，至是以兵不敌，改计从杰等。”
都说雪中送炭好过锦上添花，三镇总兵也瞄准了“定策之功”，而且还是雪中送炭，当下一拍即合，决定拥护福王。
马士英由浦口回到凤阳，得知卢九德勾结总兵高杰、黄得功、刘良佐，决定拥立福王朱由崧后，立刻将他和史可法的约定抛诸脑后，更换门庭，改拥立福王朱由崧登基。
甚至还将史可法写给他的亲笔信，面呈福王。信上的内容，是史可法关于福王七不可立的事。任谁看了这样的信，都不会高兴，史可法的失势成为必然。
至此，史可法因其优柔寡断，想面面俱到，而将大好局面葬送。朱由崧监国半个月后，被排挤出朝廷，自请督师淮、扬。
若是史可法认定应该由万历皇帝子孙继统，当机立断的把颠沛潦倒之中的福王朱由崧，从淮安接到南京继统，或许事情又是另一番走向。
东林党人在排除福王继统的阴谋破产后，又出于防微杜渐的考虑，惟恐阮大铖起用导致整个“逆案”掀翻。于是，抓住马士英推荐阮大铖一事大闹朝堂，名望甚高的刘宗周九月初三日上疏说：“大铖进退，关江左兴衰。”
可区区一个阮大钺，真的能有那么大的影响吗？
