妙蛙种子受了伤，小智关心心切，让它回来，但妙蛙种子有着不服输的性格，不打赢便不回来。
小智看妙蛙种子如此坚持，便让它使用飞叶快刀，飞叶快刀将铁甲犀牛击中，封闭了它的行动，趁机会妙蛙种子用藤鞭将它打败。
小智的妙蛙种子获胜，大叔夸奖小智非常厉害
一旁的小霞和小刚都夸奖小智的宝可梦非常有骨气
场上妙蛙种子非常不舒服，背上的大蒜头开始发光，小智和皮卡丘担忧起来
小智三人连忙将妙蛙种子送到了乔伊小姐那里，乔伊小姐看到妙蛙种子的奇异特征有些眉目，她需要在对妙蛙种子进行彻底的调查。
进入诊疗室，乔伊小姐通过仪器检查记录分析。
乔伊小姐告诉小智，妙蛙种子这是进化的预兆
小智听到妙蛙种子是要进化了，而不是生病，小智非常开心。
小智问乔伊小姐，它的妙蛙种子什么时候进化，乔伊小姐带他们来到窗户边，外边的花朵全部盛开绽放，甚至发出亮光。
乔伊小姐告诉他们，据传说妙蛙种子到了进化的预兆，都会从四处汇聚在一起，举办关于进化的庆典，庆典有可能在某个季节举办
小霞问乔伊小姐，庆典是在什么地方举办呢？
乔伊小姐告诉三人，是在不可思议花园中举办，这个花园至今还没有被人发现，有可能也只是个传说
小智三人准备去寻找不可思议花园
夜晚时分
妙蛙种子被幂幂之中的呼唤召唤，它从宝可梦中心走出。皮卡丘发现了它的异动，和它来到了外边，小智等人还在沉睡
两宠在外边看着初升的太阳，妙蛙种子突然被不知道哪里冒出的一群妙蛙种子抓走，皮卡丘准备营救，但妙蛙种子让皮卡丘回去找小智
皮卡丘便跑回到中心，用电击唤醒了睡着的小智。
醒来后的小智从皮卡丘口中得知妙蛙种子被抓走了，连忙穿起衣服。他唤醒小霞、小刚朝外面跑去
三人顺着花粉朝不可思议花园前进着，小智三人被很多不知名藤鞭纠缠，它们化成无数触手墙，朝他们抓去
在一路狂奔中，他们发现了这些藤鞭便停止追逐了，这些藤鞭在他们身后幻化成无数藤蔓，围堵住出口，让人不能轻易发现。
小智三人这才明白，为何世人都无法得知不可思议花园的位置，这里的入口是被藤鞭围住的，无法进入的。
小智三人也是误打误撞才进入其中。
三人打量四周，他们前方有棵奇异的大树，这棵树非常神奇，它的树枝可以延绵到太阳上去，吸取太阳的精华。三人断定这可能就是不可思议花园。
地下所有的妙蛙种子集中在一起，身上散发的花粉，全部朝着这棵树汇聚，大树汇聚这些花粉上的养分进行吸收，十分壮观。
不多一会儿，一只巨大的妙蛙花从树内走出，它朝着众多的妙蛙种子嗷叫。高大的气势极具威慑力
小智在这四周搜寻他的妙蛙种子，被小刚阻止了。
场上所有的妙蛙种子和妙蛙花都咆哮庆祝，很快那些嚎叫的妙蛙种子全部变成了妙蛙草，小智的妙蛙种子也不例外，它也跟着嚎叫。
妙蛙种子的身体也发出亮光，很快变成了一只体型巨大的妙蛙草。
见在场的所有妙蛙种子都进化完毕，不可思议花园举办了庆祝庆典，所有的妙蛙草和妙蛙扭着额头上大大的花朵跳舞。
火箭队又来捣乱，用大功率吸尘器将妙蛙草和妙蛙花全部抓走，只留下了小智的妙蛙草。
火箭队收服了众多的妙娃草，不缺小智这只
小智的妙娃草生气了，竟敢轻视它。
它使用了草系最强绝招，阳光烈焰打跑了火箭队三人
又用飞叶快刀将妙蛙草它们给解救下来
就这样，小智三人解救了妙蛙花它们，他的妙蛙种子进化成妙蛙草
三人继续朝着下一个目标前进
