而这时的警局空虚，黑牙组织们便趁着守备虚弱，拿着机枪武器冲进了当地的宝可梦中心和宝可梦银行将它们洗劫一空。
在出警路上接到报警电话的君沙小姐和民警们感到错愕，后来才发现这是中了敌人的调虎离山之计，懊恼的同时赶紧回去增援。
很快反应过来的警察们，将这些犯罪分子团团围住，为首的鼠一仗着在银行里绑架的人质、和警察们进行了谈判
有恃无恐的威胁这些警察，为了保卫居民们安全，警察们只能忍气吞声放走了他们
黑牙组织的成员们带着大量的现金和精灵球们坐着热气球在警察们的眼皮子底下扬长而去
小智三人在河边钓鱼，听到警笛声呼呼响起，便感觉有事发生连忙跑到镇上，看到杰尼龟们在镇上用水枪到处滋水、便想着阻止。
正要阻止杰尼龟们，天空中坐着热气球的邪恶组织-黑牙成员用捕捉枪将杰尼龟们全部抓进网中
用超级机器手将捕捉网回收上热气球、杰尼龟们眼看就要被抓走了，小智肯定不能让他们得逞
派出了比比鸟和巴大蝴，让它使用龙卷风对热气球进行攻击，让巴大蝴使用念力将杰尼龟们放下来。
比比鸟的龙卷风让热气球偏离了位置，机器手被龙卷风击中和捕虫网一起掉到地上。杰尼龟们得救了。
鼠一看到小智坏他们的好事准备出手教训他。结果地上集结了一群警察，导致他们不得不赶紧撤退、以免无法脱身。
他狠狠看了小智一眼，既然任务失败了。他当然不会让小智他们好过，让手下们在空中投掷炸弹，一颗颗炸弹从热气球上扔下
炸弹引发的爆炸很快就将周围的建筑和街道造成了破坏
君沙小姐他们看到这些犯罪分子如此丧心病狂，气得牙痒痒。他们赶紧疏散人群，让居民们能够安全的撤退。
被救下来的杰尼龟等人刚从捕捉网爬出来，正好一个炸弹不偏不倚的落在了它们的位置
杰尼龟老大推开了身边的小弟，对着炸弹使用了水枪，但是炸弹的威力还是大过于水枪的威力，没能阻止炸弹掉到别的区域，朝着杰尼龟老大额头上掉落
小智看到了杰尼龟老大的困境赶紧上去推开它，将它牢牢压在身下保护。
杰尼龟看到是小智救了它，内心并不平静。还没来的及多想，头上又掉下好几颗炸弹
小智也看见额头上又掉下来好几颗炸弹，赶紧撒开脚丫一只手抱着杰尼龟逃离
很快炸弹的余波结束，那些黑牙组织成员趁着爆炸的慌乱逃离了
现场一片狼藉，周围大量的建筑被损毁，不少房屋引发了火势造成了严重的火灾，并且火灾蔓延的非常快，君沙小姐等人赶紧组织人手去救火。
但是火势太大再加上人手不足，实在是太过杯水车薪。
小智灵机一动，让杰尼龟们使用水枪去灭火，听到小智的建议和刚刚被小智所救的杰尼龟老大当然欣然同意
于是靠着杰尼龟军团的帮助下，镇上的火势才得以熄灭，火势没有波及到居民，为了表彰杰尼龟军团所做的贡献。
君沙小姐给它们颁发了荣誉证书和聘书、聘用它们为镇上的灭火队员，居民们也渐渐认可了这些改过自新的杰尼龟
在处理完这些事后，小智三人再次踏上旅程。
在出发后小霞发现一直有龟默默跟着他们
她跟小智两人说了这件事。小智发现后三人便停下脚步，果然看见了戴着尖角墨镜的杰尼龟老大在跟着他们。
小智问它愿意跟着他吗？听到小智的发问杰尼龟开心极了，摘下了墨镜，眼中流出露出喜悦、真、诚开心的模样跑向小智的怀中
小智开心的向众人分享喜悦，说收服杰尼龟了
小霞调侃哪有这样收服的，小智笑着说说我这是人格魅力
众人有说有笑，旅途充满愉快，就这样旅行的队伍又多了一员。
