武研院基本上属于后勤范畴，所以暂时由鲁肃兼管。
马小川并不打算让鲁肃一直管着武研院，他打算以后将武研院完全独立起来，以减少各方面对武研院的干扰。
由于大量工匠的加入，马小川终于得以将许多想法付诸实践。比如试制数百年后才出现的唐刀、陌刀等，研制后世网络上甚嚣尘上的钢弩，还有根据装甲车的原理研制的冲击车（人力或畜力）等等，其中许多东西都是这个年代的人想都没有想过的。
除了这些之外，马小川还在武研院内单独分出一个部门，这个部门的工作就是根据马小川的配方生产火药，并研究火药的应用。
其实在这个时代已经有火药了，但这个时代的火药配方有很多问题，因此威力很小，一般只能用作纵火。
马小川的火药配方毫无疑问地是后世的火药配方，这个火药配方相较于东汉时期的原始配方要简单不少，就硝石、硫磺、木炭三种原料。虽然配方简单了，但威力却大了很多，可以用来做原始炸弹了。
马小川不是不想搞c4之类的烈性炸药，而是他根本就搞不清楚这类烈性炸药的成分，何况就是知道成分也没用，c4之类的烈性炸药中的成分全都是通过化工提炼的物质，在东汉末年，社会的整体生产水平根本就不可能提炼生产烈性炸药的化学物质。
要保障武研院工场的生产，原料是个关键。为了保证关键原料，铁料钢料的供应，马小川在并州掀起了大炼钢铁的运动。
如果按照东汉时期的炼铁方法，马小川就是动员全民炼铁，产量也不会高到哪里去。
好在马小川虽然是三流大学毕业的，但土高炉炼钢的方法，马小川还是知道的。
于是在马小川的指导下，工匠们及民工们在各大铁矿山附近竖起了两百座土高炉。征北军的钢铁产量在云中之战结束时，已经达到了月产钢铁五十万斤的惊人水平，其中二十万斤是钢，也就是这个年代俗称的镔铁。
如果不是铁矿的原料有限的话，钢铁产量就是再翻上几番也没有问题。而要提高铁矿的产量，在东汉末年这个时代，就只有增加人手，今后征北军俘获的俘虏能派上大用场了。
马小川在大力发展武研院的同时，还大力发展民用手工业，不仅以官办的名义开设了许多手工业工场，更鼓励民间商人开办工场。为了提高商人开办工场的积极性，马小川采取了许多措施，比如，有工场的大商队要长途贩运货物时，马小川会派征北军沿途保护。在乱世，派兵保护这个条件的诱惑是非常大的。就冲着这一条，基本上所有的商人都开办了工场。
其实，在最开始，许多商人开办工场的目的单就是为了征北军能派兵保护他们的货物。
但随着工场运转起来之后，许多商人发现，通过工场规模化生产出来的产品，成本更低了，他们能赚取的利润更高了，于是，商人们改变了最初的想法，开始仔细地经营起工场来。其中，开办工场规模最大，数目最多的要数跟征北军关系很密切的李泰，李泰在尝到甜头之后，已经将整个家族迁到了并州，一是为了更好的发展在并州的工场，二是因为李泰对征北军控制下的并州局势比较有信心。
随着各类工场在并州的蓬勃发展，征北军的财政收入是翻着个地往上涨。正是因为如此，征北军才能以一州之地负担起数十万大军的开销。然而即便征北军的财政收入增长很快，要维持目前这么庞大的军队也是相当困难的。
自从并州军团组建以来，征北军的财政便处在严重的赤字之中，到云中之战结束时，征北军的财政达到了令人心惊胆颤的最顶点，如果不尽快解决财政问题，征北军的财政势必在数月内崩溃。到时产生的连锁反应是非常危险的。
如果不是之前征北军在洛阳的收获，征北军的财政只怕是已经崩溃了。
为了解决财政问题，征北军必须尽快攻下关中，依靠董卓在眉坞的储备，足够征北军维持两年有余。
