就在小智一行人在路卡利欧的带领下，不断向着世界初始之树最上方前进的时候，一股巨大的危机在无人知晓的情况下也在悄悄靠近着。
作为世界初始之树的守护者雷吉洛克在被甩开之后，就果断的唤醒了自己的同伴，一边追捕小智等人的行踪一边发出了信号，呼唤另外两个传说中的巨人宝可梦。
用不了多久小智和路卡利欧就要面对更为强大的对手了，三个传说中的巨人宝可梦，不是谁都能抗住祂们的追捕的。
“这座岩山是活的。”
“真是大自然的奇迹，这样的矿物生命体居然存在，世界初始之树是以光为能源不知存活了多么悠久的岁月！”
“这可真是惊人的发现啊！”
就在小智忙着寻找皮卡丘的时候，琪朵也开始不断搜寻着自己的目标，她和自己的管家远程通话之后借助高科技仪器，很快分析出了世界初始之树是活着的生命体。
但是这一切都不是琪朵最想要知道的事情，她这一次追寻梦幻最主要的目标，还是探寻清楚梦幻和世界初始之树之间的联系。
雷吉洛克和雷吉艾斯以及雷吉斯奇鲁很快追上来了，借助路卡利欧的波导众人率先发现了祂们的踪迹，在这么狭隘的洞穴中若是被追上谁也活不了。
听到这个消息众人立马开始疯狂逃命，根本没有一点和三圣柱硬碰硬的想法，这种玩笑谁也不敢开出口。
毕竟那可是三个传说中的巨人宝可梦，别说是小智这几个人和路卡利欧了，就算是地区冠军来了也得落荒而逃。
好在靠着路卡利欧的波导指引，众人在如同迷宫般的洞穴内不断穿梭着，很快就甩开了三圣柱的追捕。
“呼！”
好不容易才将三圣柱甩开的小智等人刚想松一口气，就在一处拐角遇到了武藏和小次郎这两个老对手，看到了一件让人很是窒息的事情的发生。
为了找回无故消失的喵喵也为了抓到皮卡丘，武藏和小次郎偷偷的藏在了汽车的后备箱，跟着小智一行人一同进入到了世界初始之树。
“武藏等等我啊！”
“真是没用，你再不跑起来我就把你丢在这里了！”
现在武藏和小次郎的处境相当的不妙，这个时候的两人已经奔跑了有会了，小次郎感到了筋疲力尽，赶紧叫住武藏想要她拉自己一把。
人类和人类之间的差距是很大的，虽然小次郎的身体素质也算是人类中的佼佼者，但是还是没法和武藏以及希巴这类超人类相比。
虽然对于武藏没有回来拉起小次郎，但是到底停下了自己的脚步，对于她的毒舌小次郎本来想说些什么辩解，但是突然突然看到了让他心底发毛的一幕。
深红色的仿佛由岩浆组成的摇篮百合突然出现在武藏的身后，移动速度极快完全不给人反应时间，瞬间就靠近了她的身体。
“武藏，武藏你快看你的身后，快逃啊！”
咽下了原本想说的话小次郎立马发出了提醒，着急的叫着武藏快跑，他可不想看着这个志同道合的伙伴被怪物吞噬。
“哎呦！又不是小孩子了，我才不会上你的当呢！”
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