当然，其中也有郑成功积极主动配合的缘故。
毕竟以这年头的“官本位”思想，能封侯拜将，与国同休，谁特么煞笔了去干啥“海贼王”？当年胡宗宪一说诏安，“海贼王”汪直马上就屁颠屁颠赶过去，郑芝龙一听清军南下，立马就要北上投诚。
封建社会，相比于跻身贵族名门，成为稳固的统治阶级最高层，能和皇帝共富贵的诱惑，什么富可敌国，都不值一提。
而这一回，朱由榔算是正式从明面上宣告了自己和朝廷对海军的完全掌控。
首先，海军诸将中，原步师总兵陈举，算是跟随郑成功多年的老将，而且能力也强，只是年纪稍大了，调离岗位，回到南京。
在枢密院下，组建的海军署，担任都承旨，主持对中枢的海军参谋工作，免得以后海上发生战争，朱由榔和枢密院想找个专业人士问一下都没有。
而步师总兵位置，正式由干了快六年，之前因为资历问题，一直只是副将的刘国轩接任。
当然，其实真正的专业人才还是有的，而且还是当今世界数一数二的。
郑芝龙今年也五十出头，还有能用的价值，之前虽然没有担任职务，闲居在家，但也一直被南京兵学苑邀请，于学校教授部分航海知识。
这回干脆也发挥发挥余热，
于枢密院、兵部协助下，在原镇海卫，卫所废除后，现更名为宝山县的长江口处（今吴淞港），主持建立新的“海军兵学苑”，担任受任学苑祭酒，为海军培养专业人才。
除此之外，海军原本那些个由于历史遗留问题，杂七杂八的编制，这回也要统一规范了。
首先是郑成功这个都督往下的五个提督，和总兵同阶自不必提，除了一个步师提督比较特殊，其他四个，都各自统帅舰队。
提督往下，为统辖官，与陆军参将同阶，名称做区分，所属称为支舰队
再往下，为提辖官，与陆军厢总同阶，所属称为分舰队。
再具体到船上，舰长，大副，掌旗，炮长等等，各有分工，也根据重要程度，进行品阶区分。
当然，这只是级别区分，并不意味着提辖、统辖官就一定是舰队长官，毕竟海军情况和陆军大不一样，一支七八艘小船组成的分舰队，地位不会比一艘大型炮舰高。
如主力炮舰，其指挥官虽然也只是一艘船的舰长，但其头衔，却是和分舰队同等的提辖官。
除此之外，还有陆上基地、港口的人员编制，不一而足。
而且，军中展开的扫盲运动，海军也不能例外，甚至首当其冲。
部分过去干惯了海盗行当，作风实在不服管的水手离开了一线岗位。
许多新人加入海军，这在短时间内会导致战力的小幅下滑，但随着制度建设走向正轨，一支纪律严明的大明舰队，更加符合未来战略的需要。
这种规范编制，一方面是在加强对海军的控制力，另一方面也是在加强其战斗力。
反正有了这一笔充足军费，海军至少造船是能大手大脚挥霍了。
一时间，工部那边的船舶公司也笑开了花，南京的龙江船厂终于修复完成，在海军土豪式的订单之下，开始下饺子似的启动了造舰计划。
几年前，当初船舶重工公司总制，工部尚书胡璇老部下，陈子升，在接受由原郑氏工匠，和江南地区临时征召的船工们组成的船舶公司。
非常具有远见的，一方面通过修缮船只积累经验，另一方面，也不急着造舰，而是在宁波建造烘干厂房，大规模晾干、烘干木材。
毕竟这年头的木制战舰，对木材非常挑剔，树龄往往要达到数十年，乃至上百年才行，不是啥木头都能用的，必须使用晾干或者烘干的木材才行。
（1807年丹麦海军被英皇家海军全歼，丹麦王国种了颗橡树准备未来重建海军，然后这些橡木什么时候能用了呢？2007年丹麦林业部门向丹麦海军写信:树长成了可以砍去造船了......）
虽然，朱由榔一度算计着直接从东南亚深山老林砍，那里的成材木最为丰富，但眼下其实大明也不缺。
当年郑和下西洋时，在龙江船厂边种的十几万株，用于造船的各种木材，不知该庆幸还是该难过，反正由于后来朝廷再也没有大规模造军舰，绝大多数都成功保存下来，已有快两百年，都长成参天大树了......
而自然木材晾干、阴干，大概需要十年左右，当然，可以通过适当人工烘干，来加速，但这是一项技术活，好在有郑氏那帮子来自五湖四海，啥人种都有的船工匠人，倒也不算太麻烦。
经过五年多时间，第一批可用的木材已经能够投入生产了。
除了造船，专门为海军设计铸造的火炮，也提上了工部武备局研发生产日程，可以想象，未来五年内，海军的体量和规模，将会迎来一次井喷......
