先祖在与暗黑大长老谈话时征得同意后，使用了留影盒，将这件事记录下来。暗黑大长老已经被折磨的不成样子了，送先祖走时，他将暗黑魔法典封印交给了先祖，并告诉他暗黑魔法典会自己寻找主人。之后，就离开了。
先祖回来之后，将真相告诉了大家，人们都沉默了。
原来，之前在处理暗军团时铲除了暗黑族二长老，但是他的妻子怀恨在心，一心想要报仇。但是她自己一个人又无能为力，她只好暗自解开了暗黑族守护的封印，放出了宇宙间的至恶能量，献祭自己来报复所有人。而她不甘心自己就这么死去，她把自己的儿子琮染上了至恶能量，自他有意识起，就不断地被侵蚀，至恶能量剥夺了他心中原有的善良，只剩下复仇，变成傀儡一样的复仇工具。
先祖隐瞒了暗黑魔法典的事实，只说它丢了。将它封印后埋藏在能量树下。
之后夸克族开始策划为已故去的暗黑大长老正名，但是却遭到报复。暗黑族人中好战派更多于主和派，于是好战派囚禁了主和派，开始对夸克族宣战。两族交战，损失都很大，夸克族有精灵族辅助，让被侵蚀的琮生气不已，他召回了前线暗黑部队，选择了休养生息，恢复元气，一举击破夸克族。
在同时，夸克族一些参与大战的人们的驶卷使由于受伤不能及时修复而死去，夸克族的几位科学家以希丝娜和莫尔斯为代表，出发去别的星球找寻办法。一行人历经千辛万苦，终于在地球找到了方法，之后数次试验，他们终于成功了。＜疗愈之力，繁衍不绝＞＜相辅相融，相生磐古＞。但是在这之后，他们出现了分歧：在地球上的这些年，希丝娜已经爱上了地球，爱地球的每一种生物，她不忍心用地球所有生命的能量来换取夸克族的自我疗愈之力，而莫尔斯则认为终于完成了使命，要带着磐古回到夸克星，被希丝娜阻止了；最终，希丝娜将体内的驶卷使一分为二，一份与磐古相融，一份化作能量击退了莫尔斯。
希丝娜将磐古封印在地心实验室的能量树里，把开启实验室的钥匙化为五个骑士之石，交给了精灵族的万长老，由精灵族世代守护。而希丝娜与当时的夸克族长老商议过后，长老一致赞同希丝娜的做法，而希丝娜在之前的研究中发现，系统的魔法学习还是非常必要的，于是创建了萌学园魔法学校，并且将自己最后一丝能量沉睡在萌学园的核心密室中，保护地球，保护磐古。同时创立了萌骑士五星与奈亚公主，萌骑士五星对应了五颗骑士之石，以应对莫尔斯的反扑；同时也对付暗黑族。
此时，暗黑族的进攻开始了，夸克族倾全族之力与之对抗，封印了暗黑族五支其中四支，并将最后一支也就是现在暗黑大帝率领的这一支逼近了萌学园下水道里，在下水道入口设置五星封印。但是，暗黑族的至恶能量在被封印的最后一刻进入了暗黑大帝体内，于是暗黑大帝拥有无限重生的能量，因为至恶能量是全宇宙的产物，不能灭绝的。
而从那时起，黑夸大战便成为暗黑大帝不断复活与萌骑士和奈亚公主的较量。奈亚公主自出生时起就承担了要对抗暗黑大帝的使命。
